RmenuにAxlsxを組み込むのはどうだろう。

出力をxlsxで行い表計算ソフトのマクロで加工して出力するというのはどうだろう。

まだAxlsxは試してないのだが、この辺は事務屋の興味の範疇でもあるので調べてみたい。
業務システムでサーバーに表計算やマクロの機能を持たすとクライアント側にプログラムを置かなく良いというメリットがあるがExcelならライセンスの問題がややこしそう。
こんな場合、libreofficeかopenofficeのcalcを選択するしかなさそう。